2002年9月6日，瑞典空军从萨伯公司接收了第一架JAS-39C型战斗机。JAS-39C是“鹰狮”系列中最先进的一种，在JAS-39A/B上作了很多改进，改换了大型彩色综合显示器、新的计算器软件，以及对机翼结构和武器挂架进行了加强设计。“鹰狮”C具有空中受油能力，同时可以携带更多的武器。
JAS-39与瑞典空军J29喷气战斗机一起飞行。
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2003年6月，欧洲六国联合研制的“流星”中距空空导弹进入初步设计评审，六国用户对该导弹初步设计表示满意。这次设计评审的重大意义，是肯定了该导弹采用的新的无弹翼气动外形布局，这是满足用户所要求的导弹性能的最佳选择。该设计在签订合同之前进行了广泛的风洞试验，负责该项目的MBDA公司吸取了已在英国皇家空军服役的先进近距空空导弹（ASRAAM）采用的制导控制技术。这种外形布局和控制原理，使导弹获得非常高的转弯速率，同时保持冲压喷气发动机的性能。MBDA公司正准备制造该导弹的全尺寸模型，用于导弹与载机的适配，同时还制造缩小尺寸的模型，用于在今年秋季进行风洞试验。另一个重要的里程碑，是在2004年下半年进行导弹的冲压喷气发动机系统点火试验以及风洞模拟环境下的飞行试验。现在，MBDA公司正全力以赴准备该导弹的首次飞行试验，发射载机是“鹰狮”战斗机，将于2005年夏季在瑞典的维德泽尔靶场进行试验。
2004年4月，MBDA公司和SAAB航空系统公司完成JAS-39加装“流星”空空导弹的装机试验，验证了战斗机及其复式导弹发射架(MML)与“流星”空空导弹机械接口的兼容性，全部试验目标都已达到。这次加装试验成功对将于2005年秋季在瑞典维德塞尔靶场进行的首次实弹发射试验具有重大意义。2002年12月，英国国防采购局(DPA)代表联合发展该导弹的欧洲六国--英国、法国、德国、意大利、西班牙和瑞典，同MBDA公司签订价值12亿英镑（18.6亿欧元）“流星”空空导弹研制合同。现在，MBDA公司又获得了另外两种飞机的装机合同，与欧洲战斗机公司和达索航空公司合作，将“流星”空空导弹装到“台风”和“阵风”战斗机上。这三种飞机的装机综合工作，将与“流星”空空导弹的研制同步进行。该空空导弹的合同将在2010年底到期，在此之前将完成JAS-39和“台风”战斗机制导发射的相关试验。
JAS-39装配车间。
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2004年6月，瑞典空军的JAS-39战斗机装备现代侦察吊舱，使其能代替已分配给快速反应部队的AJSF37“雷”侦察机。新型SPK-39侦察吊舱是Terma公司模块式侦察吊舱系统（MPPS）的改型。吊舱直径650mm，只能吊装于“鹰狮”的机身中央挂架。在试验过程中，瑞典国防器材部在JAS-39C上安装了模型吊舱，试验证明离地距离合适。新吊舱最初打算作为低/中空战术侦察吊舱。它的主要传感器是Recon光学公司的CA-270V分幅照相机，装在旋转窗口模块内。整个传感器及其窗口旋转，拍摄范围达到地平线到地平线（±90°），因此不需要昂贵易损的全景窗口。第二阶段的综合工作预想是增加能够近乎实时侦察的数据链路，可能还有红外行扫描器和夜视传感器。随后吊舱可能成为战略侦察的基础，装备DB-110或CL-295照相机。
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